Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms