Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNE1P24864 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNE1P24864 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms