Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
S100A1P23297 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
S100A1P23297 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
S100A1P23297 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
S100A1P23297 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
S100A1P23297 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
S100A1P23297 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
S100A1P23297 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
S100A1P23297 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
S100A1P23297 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
S100A1P23297 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
S100A1P23297 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
S100A1P23297 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
S100A1P23297 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
S100A1P23297 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
S100A1P23297 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
S100A1P23297 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
S100A1P23297 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
S100A1P23297 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
S100A1P23297 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
S100A1P23297 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
S100A1P23297 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
S100A1P23297 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
S100A1P23297 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
S100A1P23297 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
S100A1P23297 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
S100A1P23297 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms