Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AMPD1P23109 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AMPD1P23109 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMPD1P23109 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMPD1P23109 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AMPD1P23109 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms