Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN3P20807 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN3P20807 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN3P20807 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN3P20807 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN3P20807 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN3P20807 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN3P20807 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN3P20807 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN3P20807 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN3P20807 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms