Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF3P20783 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF3P20783 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF3P20783 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF3P20783 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTF3P20783 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTF3P20783 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTF3P20783 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NTF3P20783 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NTF3P20783 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTF3P20783 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTF3P20783 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NTF3P20783 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms