Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-DPA1P20036 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-DPA1P20036 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms