Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPI1P17947 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPI1P17947 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPI1P17947 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPI1P17947 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPI1P17947 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPI1P17947 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPI1P17947 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPI1P17947 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPI1P17947 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SPI1P17947 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPI1P17947 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPI1P17947 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPI1P17947 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPI1P17947 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPI1P17947 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPI1P17947 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPI1P17947 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPI1P17947 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPI1P17947 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SPI1P17947 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPI1P17947 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPI1P17947 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SPI1P17947 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms