Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNB2P17787 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB2P17787 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms