Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF3P17036 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms