Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPCAMP16422 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPCAMP16422 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms