Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF4P15884 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF4P15884 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF4P15884 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF4P15884 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF4P15884 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF4P15884 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF4P15884 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TCF4P15884 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF4P15884 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF4P15884 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF4P15884 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCF4P15884 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF4P15884 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF4P15884 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF4P15884 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF4P15884 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF4P15884 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF4P15884 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF4P15884 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF4P15884 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF4P15884 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF4P15884 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF4P15884 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF4P15884 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF4P15884 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF4P15884 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF4P15884 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF4P15884 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF4P15884 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF4P15884 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF4P15884 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF4P15884 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF4P15884 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF4P15884 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF4P15884 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF4P15884 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF4P15884 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF4P15884 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms