Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ITGA4P13612 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms