Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CKBP12277 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKBP12277 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKBP12277 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKBP12277 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKBP12277 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKBP12277 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKBP12277 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKBP12277 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKBP12277 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CKBP12277 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKBP12277 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKBP12277 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKBP12277 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKBP12277 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKBP12277 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKBP12277 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKBP12277 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CKBP12277 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CKBP12277 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CKBP12277 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CKBP12277 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CKBP12277 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKBP12277 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKBP12277 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKBP12277 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CKBP12277 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKBP12277 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKBP12277 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKBP12277 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKBP12277 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CKBP12277 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKBP12277 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKBP12277 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKBP12277 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKBP12277 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKBP12277 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKBP12277 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKBP12277 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKBP12277 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CKBP12277 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CKBP12277 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKBP12277 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms