Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARBP10826 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARBP10826 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARBP10826 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARBP10826 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARBP10826 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARBP10826 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARBP10826 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARBP10826 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RARBP10826 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARBP10826 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARBP10826 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARBP10826 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARBP10826 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARBP10826 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARBP10826 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARBP10826 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARBP10826 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARBP10826 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARBP10826 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARBP10826 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RARBP10826 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARBP10826 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARBP10826 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARBP10826 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARBP10826 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARBP10826 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARBP10826 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARBP10826 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARBP10826 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARBP10826 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms