Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGA3P0DJD8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGA3P0DJD8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms