Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD1P0DJD0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD1P0DJD0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms