Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC166P0CW27 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC166P0CW27 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms