Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC6P09630 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC6P09630 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms