Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP1A1P05023 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP1A1P05023 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms