Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRBV12-3P01733 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms