Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
F2P00734 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F2P00734 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F2P00734 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F2P00734 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
F2P00734 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F2P00734 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F2P00734 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F2P00734 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F2P00734 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F2P00734 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
F2P00734 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F2P00734 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F2P00734 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F2P00734 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F2P00734 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
F2P00734 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F2P00734 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F2P00734 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F2P00734 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F2P00734 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F2P00734 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F2P00734 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F2P00734 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F2P00734 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F2P00734 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F2P00734 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F2P00734 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F2P00734 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F2P00734 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F2P00734 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F2P00734 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F2P00734 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F2P00734 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F2P00734 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
F2P00734 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F2P00734 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F2P00734 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F2P00734 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F2P00734 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F2P00734 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F2P00734 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F2P00734 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F2P00734 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms