Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms