Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MBD3O95983 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MBD3O95983 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MBD3O95983 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MBD3O95983 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD3O95983 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD3O95983 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD3O95983 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MBD3O95983 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD3O95983 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD3O95983 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD3O95983 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD3O95983 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD3O95983 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD3O95983 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MBD3O95983 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD3O95983 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD3O95983 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD3O95983 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD3O95983 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MBD3O95983 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD3O95983 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD3O95983 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms