Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF6BO95407 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms