Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL5O76039 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL5O76039 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 398.1 ms