Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCATO75600 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCATO75600 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCATO75600 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GCATO75600 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCATO75600 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCATO75600 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCATO75600 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCATO75600 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCATO75600 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCATO75600 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms