Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLO75128 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLO75128 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COBLO75128 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLO75128 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLO75128 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLO75128 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLO75128 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLO75128 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLO75128 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLO75128 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLO75128 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLO75128 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLO75128 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLO75128 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLO75128 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLO75128 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLO75128 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLO75128 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLO75128 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLO75128 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLO75128 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLO75128 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLO75128 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLO75128 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLO75128 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLO75128 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms