Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBNO60934 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBNO60934 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBNO60934 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBNO60934 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBNO60934 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBNO60934 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBNO60934 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBNO60934 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBNO60934 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBNO60934 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBNO60934 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBNO60934 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBNO60934 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBNO60934 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBNO60934 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NBNO60934 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBNO60934 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBNO60934 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBNO60934 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBNO60934 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms