Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ABCC9O60706 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.67■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ABCC9O60706 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms