Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNCRIPO60506 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 526.1 ms