Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUPR1O60356 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUPR1O60356 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms