Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL13O43927 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms