Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTIFO43310 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTIFO43310 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTIFO43310 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTIFO43310 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTIFO43310 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTIFO43310 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTIFO43310 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTIFO43310 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTIFO43310 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTIFO43310 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTIFO43310 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTIFO43310 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTIFO43310 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTIFO43310 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTIFO43310 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTIFO43310 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTIFO43310 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTIFO43310 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTIFO43310 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTIFO43310 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTIFO43310 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTIFO43310 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTIFO43310 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTIFO43310 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTIFO43310 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTIFO43310 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTIFO43310 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTIFO43310 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTIFO43310 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTIFO43310 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTIFO43310 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTIFO43310 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTIFO43310 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
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