Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLRMTO00411 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLRMTO00411 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms