Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NACAE9PAV3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NACAE9PAV3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms