Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HACD1B0YJ81 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms