Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A6NNZ2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A6NNZ2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A6NNZ2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A6NNZ2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A6NNZ2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NNZ2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NNZ2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NNZ2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms