Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RCCD1A6NED2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCCD1A6NED2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms