Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms