Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS37CA5D8V6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS37CA5D8V6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms