Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE9A4FU28 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE9A4FU28 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms