Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF22A3QJZ6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms