Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FRMD3A2A2Y4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.7 ms