Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 LIAS-213ENST00000639422 4115 ntTSL 58.93□□□□□ -0.988e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-203ENST00000381846 1578 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.998e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-220ENST00000640689 2080 ntTSL 58.79□□□□□ -18e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -18e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-205ENST00000419071 1491 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.018e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-201ENST00000261434 1258 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.018e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-209ENST00000638430 1237 ntTSL 58.74□□□□□ -1.018e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 AP000275.2-201ENST00000431216 891 ntAPPRIS P1 TSL 58.69□□□□□ -1.028e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.038e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-222ENST00000640888 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.038e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-217ENST00000640381 2259 ntTSL 58.57□□□□□ -1.048e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.058e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CHD9-219ENST00000569225 1862 ntTSL 28.26□□□□□ -1.098e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CACUL1-207ENST00000544392 1060 ntTSL 28.15□□□□□ -1.12e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-210ENST00000638451 1159 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.118e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ARHGAP19-206ENST00000492211 5525 ntTSL 27.74□□□□□ -1.178e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ARNT-207ENST00000504358 571 ntTSL 47.72□□□□□ -1.178e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-214ENST00000487101 927 ntTSL 57.69□□□□□ -1.188e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-217ENST00000542013 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.228e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 NUP98-206ENST00000397013 939 ntTSL 57.23□□□□□ -1.258e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 TRPM7-209ENST00000561443 1193 ntTSL 27.05□□□□□ -1.288e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ARNT-209ENST00000505979 570 ntTSL 26.95□□□□□ -1.38e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 NUP98-214ENST00000527104 705 ntTSL 36.92□□□□□ -1.38e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.348e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CACUL1-204ENST00000489169 517 ntTSL 26.53□□□□□ -1.362e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ARHGAP19-205ENST00000487035 4553 ntTSL 26.31□□□□□ -1.48e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 PRPSAP2-207ENST00000422237 1038 ntTSL 56.3□□□□□ -1.48e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-207ENST00000515061 662 ntTSL 35.98□□□□□ -1.458e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 XRCC5-206ENST00000460284 2962 ntTSL 1 (best)5.94□□□□□ -1.468e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 RSBN1L-205ENST00000462800 656 ntTSL 55.79□□□□□ -1.488e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.58e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 XRCC5-207ENST00000471649 610 ntTSL 25.51□□□□□ -1.538e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 UBR1-208ENST00000569066 2250 ntTSL 1 (best)5.47□□□□□ -1.538e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ADAM10-208ENST00000475898 674 ntTSL 45.45□□□□□ -1.548e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.558e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ADAM10-210ENST00000482945 2333 ntTSL 25.24□□□□□ -1.578e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 METTL4-202ENST00000573134 5190 ntTSL 1 (best)5.1□□□□□ -1.598e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ZNF638-227ENST00000601581 574 ntTSL 55.1□□□□□ -1.598e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 STT3A-205ENST00000525946 1383 ntTSL 25.08□□□□□ -1.68e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 UBR1-205ENST00000564540 735 ntTSL 34.96□□□□□ -1.628e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-219ENST00000640672 1403 ntTSL 54.92□□□□□ -1.628e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CNOT8-220ENST00000522139 566 ntTSL 34.91□□□□□ -1.628e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 NUP98-216ENST00000529379 536 ntTSL 34.89□□□□□ -1.638e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 DPY19L1-202ENST00000428054 255 ntTSL 54.88□□□□□ -1.638e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 RSBN1L-206ENST00000468035 585 ntTSL 34.87□□□□□ -1.638e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 GTSF1-203ENST00000546739 567 ntTSL 44.67□□□□□ -1.668e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 NOL8-220ENST00000538802 418 ntTSL 24.61□□□□□ -1.678e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 TRPM7-202ENST00000558444 465 ntTSL 34.56□□□□□ -1.688e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 TNRC6A-217ENST00000569376 610 ntTSL 54.56□□□□□ -1.688e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 STT3A-207ENST00000526364 617 ntTSL 34.42□□□□□ -1.78e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ADAM10-209ENST00000481164 750 ntTSL 34.36□□□□□ -1.718e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 DMXL1-204ENST00000504031 569 ntTSL 44.26□□□□□ -1.738e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 XPO1-216ENST00000469337 568 ntTSL 44.14□□□□□ -1.751e-15■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 GTSF1-206ENST00000549083 575 ntTSL 54.12□□□□□ -1.758e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 RPN2-206ENST00000456400 453 ntTSL 34.1□□□□□ -1.751e-8■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 FKBP4-202ENST00000538622 572 ntTSL 54.02□□□□□ -1.778e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 TRPM7-206ENST00000560849 624 ntTSL 33.92□□□□□ -1.788e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 TNRC6A-218ENST00000569634 552 ntTSL 23.91□□□□□ -1.788e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 UBR1-209ENST00000569243 702 ntTSL 33.7□□□□□ -1.828e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-211ENST00000638816 675 ntTSL 53.7□□□□□ -1.828e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.838e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ADAM10-206ENST00000462061 436 ntTSL 33.61□□□□□ -1.838e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ALYREF-201ENST00000504015 254 ntTSL 33.58□□□□□ -1.848e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ADAM10-207ENST00000470269 1693 ntTSL 1 (best)3.41□□□□□ -1.868e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 NUP98-218ENST00000530516 391 ntTSL 23.04□□□□□ -1.928e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.938e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 USP15-219ENST00000552997 533 ntTSL 43.25□□□□□ -1.892e-10■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ACIN1-209ENST00000553790 756 ntTSL 210.55□□□□□ -0.728e-14■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 EPS8L2-211ENST00000527832 1597 ntTSL 219.14■□□□□ 0.652e-9■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.361e-7■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.441e-7■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 SEPT10-203ENST00000397714 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.531e-7■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.551e-7■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 SERPINF1-208ENST00000572517 672 ntTSL 210.58□□□□□ -0.721e-7■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 SEPT10-205ENST00000415095 1605 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.011e-7■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 SEPT10-211ENST00000468616 531 ntTSL 44.08□□□□□ -1.761e-7■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 EPB41-208ENST00000460378 5212 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.841e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 CHD2-209ENST00000627185 533 ntTSL 37.72□□□□□ -1.172e-11■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ZCCHC7-208ENST00000497924 699 ntTSL 25.62□□□□□ -1.514e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ZCCHC7-205ENST00000481507 903 ntTSL 24.95□□□□□ -1.624e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 ZCCHC7-207ENST00000496099 721 ntTSL 34.55□□□□□ -1.684e-6■□□□□ 8.7
SF3B4Q15427 BPTF-208ENST00000544778 7573 ntTSL 519.07■□□□□ 0.645e-13■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.495e-13■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 ATP6V0A1-218ENST00000588629 1797 ntTSL 217.16■□□□□ 0.345e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CDC34-206ENST00000606400 899 ntTSL 217.11■□□□□ 0.335e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NARF-219ENST00000582585 891 ntTSL 516.19■□□□□ 0.185e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 HBS1L-215ENST00000529882 544 ntTSL 414.55□□□□□ -0.085e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.145e-13■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.155e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CDC34-204ENST00000593036 359 ntTSL 313.68□□□□□ -0.225e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.245e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.245e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.615e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 ARFGEF1-202ENST00000517955 1235 ntTSL 210.25□□□□□ -0.775e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 HBS1L-201ENST00000314674 980 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.875e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 ARFGEF1-205ENST00000518789 646 ntTSL 59.29□□□□□ -0.925e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NR2C2-209ENST00000439011 698 ntTSL 39.08□□□□□ -0.965e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.155e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 MLXIP-207ENST00000538061 1078 ntTSL 37.74□□□□□ -1.175e-7■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 ARFGEF1-204ENST00000518290 3179 ntTSL 27.34□□□□□ -1.235e-7■□□□□ 8.6
Retrieved 100 of 47,349 protein–RNA pairs in 3805 ms