Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 WDR13-208ENST00000486125 936 ntTSL 218.97■□□□□ 0.632e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 WDR13-209ENST00000492715 2612 ntTSL 517.69■□□□□ 0.422e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 ANKRD10-209ENST00000489973 745 ntTSL 38.57□□□□□ -1.046e-19■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 ANKRD10-204ENST00000463156 395 ntTSL 37.86□□□□□ -1.156e-19■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 ANKRD10-205ENST00000464579 128 ntTSL 33.53□□□□□ -1.846e-19■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 AL355987.4-202ENST00000459985 1900 ntTSL 224.04■■□□□ 1.441e-20■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.352e-8■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 MAFK-202ENST00000403150 2773 ntTSL 223.7■■□□□ 1.391e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 ATIC-207ENST00000443953 2187 ntTSL 220.81■□□□□ 0.921e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 KANSL1-214ENST00000576739 592 ntTSL 220.33■□□□□ 0.851e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.821e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.691e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 KANSL1-225ENST00000639356 1717 ntTSL 518.87■□□□□ 0.611e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 DOCK6-205ENST00000586702 1249 ntTSL 217.86■□□□□ 0.453e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 KANSL1-209ENST00000574655 1681 ntTSL 516.61■□□□□ 0.251e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 KANSL1-222ENST00000639099 1724 ntTSL 516.31■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NELFCD-209ENST00000486263 708 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-8■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 KANSL1-221ENST00000638902 1971 ntTSL 213.54□□□□□ -0.241e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CHRD-209ENST00000461120 683 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 DOCK6-210ENST00000588666 444 ntTSL 512.23□□□□□ -0.453e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PTK2-204ENST00000510126 580 ntTSL 411.49□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 KANSL1-217ENST00000638269 3365 ntTSL 510.7□□□□□ -0.71e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PTK2-230ENST00000521250 592 ntTSL 49.42□□□□□ -0.91e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PRKAR1A-219ENST00000589480 549 ntTSL 29.23□□□□□ -0.931e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PTK2-236ENST00000521981 552 ntTSL 59.05□□□□□ -0.961e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PRKAR1A-208ENST00000585815 553 ntTSL 58□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PTK2-227ENST00000521029 584 ntTSL 47.07□□□□□ -1.281e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 ATIC-203ENST00000426233 713 ntTSL 25.01□□□□□ -1.611e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 ATIC-209ENST00000446622 615 ntTSL 34.32□□□□□ -1.721e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PTK2-217ENST00000519899 762 ntTSL 24.16□□□□□ -1.741e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PTK2-250ENST00000523746 574 ntTSL 44.09□□□□□ -1.751e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PTK2-247ENST00000523670 542 ntTSL 43.59□□□□□ -1.831e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.841e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PTK2-210ENST00000519024 576 ntTSL 42.86□□□□□ -1.951e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 PTK2-245ENST00000523474 567 ntTSL 51.82□□□□□ -2.121e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CCDC183-206ENST00000484858 422 ntTSL 318.23■□□□□ 0.513e-41■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 RBBP7-211ENST00000486166 1535 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.881e-9■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 RBBP7-205ENST00000416035 857 ntTSL 37.17□□□□□ -1.261e-9■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 DHX30-208ENST00000461905 591 ntTSL 216.27■□□□□ 0.23e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SMG7-210ENST00000502375 566 ntTSL 514.64□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.223e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LRPPRC-205ENST00000447246 1209 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.333e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 TMBIM1-218ENST00000453776 561 ntTSL 312.8□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 KIF13A-210ENST00000506044 810 ntTSL 411.84□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CALM2-206ENST00000482532 1891 ntTSL 211.08□□□□□ -0.641e-8■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 510.85□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NUP214-222ENST00000530630 536 ntTSL 310.66□□□□□ -0.73e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 TMBIM1-212ENST00000444000 571 ntTSL 410.35□□□□□ -0.753e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LCP2-210ENST00000628092 2421 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SLC25A13-206ENST00000490072 578 ntTSL 59.94□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.873e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GPANK1-206ENST00000445768 822 ntTSL 39.29□□□□□ -0.923e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GFM2-206ENST00000509097 1004 ntTSL 1 (best)8.87□□□□□ -0.993e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NDUFA10-211ENST00000476216 817 ntTSL 28.74□□□□□ -1.013e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SLC25A13-204ENST00000484495 540 ntTSL 58.53□□□□□ -1.043e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NDUFA10-208ENST00000444548 621 ntTSL 38.11□□□□□ -1.113e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GPANK1-207ENST00000456540 627 ntTSL 37.82□□□□□ -1.163e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 KIF13A-206ENST00000502297 4009 ntTSL 57.75□□□□□ -1.173e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 KIF13A-202ENST00000358380 4200 ntTSL 1 (best)7.66□□□□□ -1.183e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.273e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 IMMT-211ENST00000490238 699 ntTSL 47.05□□□□□ -1.283e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.343e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LCP2-205ENST00000520344 666 ntTSL 56.23□□□□□ -1.413e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SMARCC2-213ENST00000552627 409 ntTSL 35.37□□□□□ -1.553e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 TRIM24-205ENST00000493595 811 ntTSL 35.13□□□□□ -1.593e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SMG7-208ENST00000493609 624 ntTSL 35.03□□□□□ -1.63e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GFM2-208ENST00000513331 469 ntTSL 24.14□□□□□ -1.753e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.863e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NDUFA10-209ENST00000448880 434 ntTSL 52.12□□□□□ -2.073e-6■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CALM2-205ENST00000460218 4502 ntTSL 1 (best)1.83□□□□□ -2.121e-8■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GPAA1-207ENST00000526341 557 ntTSL 519.95■□□□□ 0.782e-16■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GPAA1-213ENST00000530258 535 ntTSL 418.89■□□□□ 0.612e-16■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GPAA1-217ENST00000532758 1079 ntTSL 318.2■□□□□ 0.52e-16■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.447e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SLC25A30-205ENST00000522438 453 ntTSL 523.37■■□□□ 1.337e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NFKBIZ-204ENST00000461724 1338 ntTSL 522.13■■□□□ 1.137e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SEPT7-216ENST00000635172 509 ntTSL 221.8■■□□□ 1.087e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SEPT7-219ENST00000635476 506 ntTSL 521.8■■□□□ 1.087e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.827e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.757e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 KIF13B-204ENST00000523130 1267 ntTSL 519.24■□□□□ 0.677e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.527e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.427e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.427e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NR1H3-218ENST00000473222 549 ntTSL 417.35■□□□□ 0.377e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.367e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SLC25A30-203ENST00000519547 582 ntTSL 416.94■□□□□ 0.37e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.267e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.267e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 TMEM18-204ENST00000418447 623 ntTSL 315.84■□□□□ 0.137e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.087e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.077e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.077e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.047e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 NR1H3-227ENST00000498548 559 ntTSL 315.22■□□□□ 0.037e-7■□□□□ 9.7
EFTUD2Q15029 SLC25A30-202ENST00000463262 426 ntTSL 315.17■□□□□ 0.027e-7■□□□□ 9.7
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