Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
U3KQ87 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQ87 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQ87 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQ87 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQ87 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQ87 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQ87 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQ87 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQ87 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQ87 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQ87 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQ87 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQ87 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQ87 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms