Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN6Q9Y6Q1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms