Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z0

BACE2, Beta-secretase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE2Q9Y5Z0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BACE2Q9Y5Z0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BACE2Q9Y5Z0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms