Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms